Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTL3Q8N8U3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTL3Q8N8U3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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