Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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