Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms