Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms