Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM198BQ6UWH4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms