Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SMARCD3Q6STE5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SMARCD3Q6STE5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SMARCD3Q6STE5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SMARCD3Q6STE5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SMARCD3Q6STE5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SMARCD3Q6STE5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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