Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA8Q53HL2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms