Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RTL8BQ17RB0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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