Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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