Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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GABRA6Q16445 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
GABRA6Q16445 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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