Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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NTRK3Q16288 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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NTRK3Q16288 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NTRK3Q16288 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NTRK3Q16288 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NTRK3Q16288 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NTRK3Q16288 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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NTRK3Q16288 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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