Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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