Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms