Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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