Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE7AQ13946 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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