Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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