Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NAE1Q13564 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NAE1Q13564 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NAE1Q13564 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NAE1Q13564 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NAE1Q13564 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NAE1Q13564 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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NAE1Q13564 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms