Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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