Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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PTPRJQ12913 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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