Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
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