Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms