Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms