Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms