Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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H3F3AP84243 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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H3F3AP84243 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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H3F3AP84243 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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H3F3AP84243 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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H3F3AP84243 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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