Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM5CP41229 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms