Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL9P32969 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms