Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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CASQ1P31415 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASQ1P31415 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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