Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms