Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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