Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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