Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC130P13994 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms