Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODC1P11926 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODC1P11926 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms