Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD2P0DJD1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms