Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6BP04259 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms