Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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HOXA3O43365 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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HOXA3O43365 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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