Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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HOXA2O43364 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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HOXA2O43364 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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HOXA2O43364 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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HOXA2O43364 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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