Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLOCKO15516 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLOCKO15516 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms