Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID3CA6NKF2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms