Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms