Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNRC6BQ9UPQ9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms