Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms