Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMGXB4Q9UGU5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms