Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC4Q9UBN4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms