Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms