Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms