Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms