Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFT27Q9BW83 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFT27Q9BW83 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms