Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THUMPD3Q9BV44 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms