Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FGD4Q96M96 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGD4Q96M96 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms