Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHFRQ96EP1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHFRQ96EP1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms